Une percée récente dans la compréhension de la pandémie de Covid-19 a permis de mettre en lumière le rôle crucial des infections persistantes dans l’évolution du virus… et de comprendre les mécanismes qui sous-tendent le Covid long et la pandémie.
Une étude récemment publiée dans la revue Nature, révèle que de nombreuses infections par le SARS-CoV-2 dans la population générale deviennent persistantes, durant un mois ou plus. Cette découverte éclaire d’un jour nouveau la dynamique de la pandémie de Covid-19, notamment en ce qui concerne l’émergence de nouveaux variants et les défis posés par le Covid long.
Les caractéristiques des infections persistantesJusqu’à récemment, l’hypothèse dominante attribuait la genèse des variants du virus, tels que Alpha et Omicron, aux infections prolongées chez les personnes immunodéprimées.
Cependant, l’étendue et les implications des infections persistantes au sein de la population générale restaient peu comprises. Cette nouvelle étude comble cette lacune en analysant les données de l’Enquête sur l’infection par la Covid de l’Office des statistiques nationales (ONS-CIS) du Royaume-Uni, impliquant plus de 90 000 participants et s’étendant de novembre 2020 à août 2022.
Sur ce total, 3 603 personnes ont fourni deux échantillons positifs ou plus, permettant le séquençage du virus. Parmi elles, 381 ont été identifiées avec des infections persistantes d’un mois ou plus, dont 54 ont duré au moins deux mois.
Les chercheurs estiment qu’entre 0,1 % et 0,5 % de toutes les infections par le SARS-CoV-2 peuvent devenir persistantes et durer 60 jours ou plus.
De façon surprenante, certaines de ces infections persistantes étaient dues à des variants du virus depuis disparus dans la population générale, soulignant la rareté de la réinfection par le même variant, probablement grâce à l’immunité développée par l’hôte.
L’étude a également examiné la relation entre infections persistantes et Covid long, révélant que les personnes avec des infections persistantes étaient 55 % plus susceptibles de rapporter des symptômes de Covid long plus de 12 semaines après le début de l’infection, comparativement à ceux ayant eu des infections plus courtes.
Les chercheurs ont observé chez certains individus un nombre élevé de mutations, y compris celles caractérisant de nouveaux variants et modifiant la protéine Spike du virus. Toutefois, la majorité des infections persistantes ne présentait pas un grand nombre de mutations, indiquant que toutes les infections persistantes ne sont pas nécessairement des sources de variants préoccupants.
Cette étude souligne l’importance de la surveillance génomique communautaire pour comprendre l’évolution du SARS-CoV-2 et ses implications pour la santé publique, notamment en ce qui concerne le Covid long et l’émergence de nouveaux variants. Elle offre des perspectives essentielles sur la dynamique virale prolongée et ses effets potentiels sur la pathologie du Covid long.
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